星球大战前传Ⅰ：幽灵的威胁
古老的银河共和国开始在偏远星系征收贸易航线税，这一举措在银河议会引起极大的争议。在西斯尊主达斯？西迪厄斯的操纵下，贸易联盟利用其新组建的机器人大军封锁了帕尔帕廷议员的家乡——纳布星系，旨在抗议新税种的出台，同时检验新军队的战斗力。
贸易联盟的叛乱令最高议长瓦洛伦内外交困。他越权将两位绝地武士——奎-冈？金和欧比-万？克诺比——秘密派遣至贸易联盟封锁部队的旗舰，会见纽特？冈雷总督。冈雷很清楚，绝地此行没有获得议会的批准，于是联系了西迪厄斯。西迪厄斯命令冈雷杀死绝地，摧毁绝地的飞船，入侵纳布。奎-冈和欧比-万死里逃生，还从侵略者手中救出了帕德梅？阿米达拉女王。他俩说服女王乘坐皇家星际飞船冲出封锁线，以便把入侵的消息带到共和国的首都科洛桑星球。
皇家星际飞船在逃亡时受损，被迫转飞赫特人控制下的沙漠星球塔图因。奎-冈一行在那里遇到了小奴隶阿纳金？天行者，发现他天生就与原力有着惊人的联系。在阿纳金的帮助下，奎-冈收集齐了修复飞船所必需的零配件。在返回飞船的途中，他们遭到神秘西斯武士达斯？摩尔的袭击。绝地武士摆脱这名西斯后，与阿米达拉和阿纳金一起直飞科洛桑。
在首都，阿米达拉试图说服议会援助纳布，但议会的官僚政治和不作为使她未能如愿。年轻的女王失望透顶，只能要求对瓦洛伦进行不信任投票，为新议长的改选铺平道路。阿米达拉决定返回纳布抵抗贸易联盟的入侵，绝地委员会派遣奎-冈和欧比-万保护她。
在纳布，年轻的女王率队攻入被占领的锡德城，逮捕了冈雷总督。达斯？摩尔刺死了奎-冈，自己却被欧比-万腰斩。临终前，奎-冈要欧比-万收阿纳金为徒。最终的胜利是小阿纳金带来的：他驾机摧毁了机器人控制舰，导致贸易联盟的战斗机器人全部关闭。
贸易联盟看似在纳布之战中落败，但达斯？西迪厄斯实现了自己的目标，没有让任何人怀疑到这场阴谋的实质。人们对纳布的同情让西迪厄斯假扮的帕尔帕廷赢得了最高议长的选举。共和国的权力杠杆已掌握在西斯尊主的手中。
星球大战前传Ⅱ：克隆人的进攻
银河共和国陷入动荡，数千个星系表达了想脱离共和国的意向。人数不多的绝地武士团已难以维持共和国的和平与秩序。这场分离主义运动的领导人是神秘的杜库伯爵。杜库曾是绝地大师，脱离绝地武士团后，成为“失落的二十人”之一。
前任纳布女王帕德梅？阿米达拉议员准备前往银河议会参加建军法案的投票。但刚抵达科洛桑，她的星际飞船就发生了爆炸，差点置其于死地。接着，阿纳金？天行者和欧比-万？克诺比又挫败了第二起针对她的暗杀行动。为了阿米达拉的安全着想，天行者护送她回到纳布，两人坠入了爱河。而欧比-万则根据杀手留下的蛛丝马迹来到卡米诺星系。在那里，他发现克隆专家——表面上是根据共和国的合同——在最近十年内培育了一支军队，其基因模板来自暗杀阿米达拉的赏金猎人詹戈？费特。
把这一惊人发现报告绝地委员会后，克诺比尾随费特来到吉奥诺西斯星系。在行星的巢穴工厂里，他获悉真相：费特接受了为杜库伯爵效力的合同，吉奥诺西斯人生产了数以百万计的战斗机器人，杜库说服各企业出资人签字成为独立星系邦联的正式成员。克诺比把情况向共和国报告后，被杜库的机器人俘虏。
由于预见到母亲的痛苦，天行者回到塔图因，可他没能阻止塔斯肯袭击者将其母亲折磨致死。他和阿米达拉前往吉奥诺西斯援助克诺比，却不幸被俘。克诺比、天行者和阿米达拉被判死刑。吉奥诺西斯人把他们送入行刑角斗场，让野兽的尖牙利爪来处决他们。
共和国的增援部队令这一切化险为夷。绝地大师梅斯？温杜率领两百名绝地对抗杜库的部队，他本人在战场上将詹戈斩首。绝地大师尤达很快从卡米诺带来了二十多万克隆人士兵。这支仓促组建的共和国常备军经受住了吉奥诺西斯一役的战火考验。克隆人战争由此爆发，绝地以军官的身份加入共和国武装力量，指挥克隆人部队。
阿纳金和帕德梅在纳布秘密结婚。
星球大战前传Ⅲ：西斯的复仇
席卷银河的克隆人战争进入到第三年，恐怖的分离势力机器人军官格里弗斯将军奇袭共和国首都，绑架了最高议长帕尔帕廷。就在分离势力舰队企图带着人质逃离科洛桑时，欧比-万？克诺比和阿纳金？天行者登上分离势力的旗舰“无形之手”号，展开了营救行动。
阿纳金救出议长，将杜库伯爵斩首，然后控制“无形之手”号迫降科洛桑地表。被击败的分离势力舰队退守外环星域。分离势力的末日似乎不远了，但帕尔帕廷命令绝地将军们加强进攻，拒绝和平谈判。
梅斯？温杜逐渐相信议长为了个人私利而想延长战争。很快，阿纳金？天行者知道了帕尔帕廷的真实身份——达斯？西迪厄斯，并告知了温杜。由于尤达在卡西克星球忙于应付分离势力的进攻，欧比-万在尤塔帕星球奋力追杀格里弗斯将军，因此温杜独自率队前去逮捕帕尔帕廷。
因对绝地心生不满，黑暗面的怒火吞噬了阿纳金？天行者，他协助恐怖强大的帕尔帕廷砍倒了温杜。被帕尔帕廷赐名为达斯？维德后，他率领一个军团的克隆人士兵剿灭了绝地圣殿中的昔日同伴。帕尔帕廷启动了早已计划好的自动预防机制——66号指令。遍布银河的克隆人士兵向他们的绝地长官开火。维德赶赴穆斯塔法星球，将分离主义委员会一网打尽，结束了克隆人战争。在议会的欢呼声中，帕尔帕廷称帝，改组银河共和国为银河帝国。
尤达和欧比-万？克诺比逃过一劫。他们搭乘贝尔？奥加纳议员的“坦蒂夫四号”飞船返回科洛桑。尤达在银河议院与新加冕的皇帝展开决斗。同时，欧比-万紧随阿纳金来到穆斯塔法。这对曾经的师徒也展开了生死对决。
尤达无法抵御皇帝的西斯威力。他撤离科洛桑，与贝尔？奥加纳来到波利斯马萨小行星。欧比-万在熔岩湖的岸边砍断了阿纳金的双腿和右臂，让他趴在熔岩湖的岸边燃烧。但阿纳金被紧随而至的皇帝救走。欧比-万也来到波利斯马萨，跟尤达、贝尔？奥加纳一起见证了天行者双胞胎兄妹的出世以及他们的母亲帕德梅？阿米达拉的去世。而阿纳金在经受了痛苦的外科手术后，被改造成一个半机器人。
阿纳金的女儿莱娅交由奥加纳夫妇在奥德朗星球抚养。欧比-万将阿纳金的儿子卢克带到塔图因，交给阿纳金异父异母的兄弟欧文？拉尔斯抚养。
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