计算机化学实践基础教程

　　前言
　　第一章 化学信息学网络资源
　　第一节 化学信息学数据库
　　第二节 电子图书阅读工具——Adobe Acrobat
　　第三节 蛋白质结构数据库
　　第四节 文献数据库——Web of Science
　　参考文献
　　第二章 分子结构绘制及显示
　　第一节 小分子结构绘制及创建——ChemDraw
　　第二节 小分子结构显示——Chem3D
　　第三节 生物大分子结构显示——VMD
　　第四节 生物大分子结构显示——Spdbv
　　参考文献
　　第三章 Linux基础
　　第一节 Linux简介
　　第二节 文件操作命令
　　第三节 目录操作及联机帮助命令
　　第四节 进程及其管理
　　第五节 文本编辑
　　参考文献
　　第四章 分子模拟
　　第一节 分子对接——AutoDock
　　第二节 分子动力学模拟——AMBER
　　第三节 量子化学计算——Gaussian
　　参考文献
　　第五章 数据传输
　　第一节 常规下载——FlashGet
　　第二节 数据上传——CuteFTP
　　第三节 远程连接——Xmanager
　　参考文献
　　第六章 数据分析与绘图
　　第一节 数据分析——Excel
　　第二节 数据绘图——Origin
　　第三节 统计软件——SPSS
　　参考文献
　　第七章 图像处理
　　第一节 简单绘图——画图附件
　　第二节 图像编辑——Photoshop
　　第三节 图像绘制——CorelDraw
　　参考文献
　　第八章 计算机应用基础
　　第一节 文本编辑——Word
　　第二节 文本列操作——UltraEdit
　　第三节 流程图绘制——Visio
　　第四节 演示文稿制作——PowerPoint
　　参考文献
　　第九章 Perl语言初步
　　第一节 Perl安装及启动
　　第二节 Perl的基本语法
　　第三节 Perl的使用实例
　　参考文献
　　第十章 HIV-1整合酶与L708，906抑制剂结合模式及运动性的研究
　　第一节 计算方法
　　第二节 结果与讨论
　　第三节 与《计算机化学实践基础教程》的关联
　　参考文献
　　附录

　　胡建平，1978年生，博士，教授，湖南永州人。1999年毕业于吉林大学生命科学学院生物制药专业；2008年毕业干北京工业大学生命科学与生物工程学院生物医学工程专业，获得北京工业大学优秀博士学位论文奖。从2000年至今，一直从事生物大分子结构及动力学的计算机模拟和分子设计研究。目前主要致力于蛋白质一配体的相互作用与复合物结构预测、蛋白质折叠机理与功能研究，以及计算机辅助药物设计与筛选等方面的研究工作。在国内外期刊及会议上发表学术论文60余篇，SCI检索30余篇。主持2项国家自然科学基金、2项教育部等省部级基金和4项教育厅等市厅级基金。目前是中国生物物理学会会员，四川省“生物有机化学与表面科学重点实验室”主要成员，乐山师范学院校级研究机构“分子设计中心”主任。

　　计算机化学是以计算机为技术手段，建立化学化工信息资源化和智能化处理的一套理论和方法。《计算机化学实践基础教程》针对学生在计算机化学学习及研究过程中可能会遇到的各种问题，以直观的图文注解方式进行讲解，并穿插操作技巧和方法。《计算机化学实践基础教程》包括化学信息库、化学分子结构绘制、Linux基础知识、计算机化学模拟、数据处理及作图、Perl程序编写等内容。每一章均自成体系，可单独阅读。《计算机化学实践基础教程》最后给出一个计算机化学科学研究实例，总结了各个章节在该实例中的应用。
　　《计算机化学实践基础教程》可作为高等院校的化学信息学、生物物理学及其他相关专业教材，也可作为相关领域研究人员的入门教材，对信息处理人员也有一定的参考作用。