基本原理1
1病原菌是怎样形成的？3
1．1引言3
1．2灵活基因库的组成4
1．3基因组动力学机制5
1．4以大肠杆菌为模型展示细菌的基因组优化5
1．5感染过程中基因组的可塑性7
1．6结论7
2中性粒细胞的抗菌机制13
2．1引言13
2．2募集到感染部位14
2．3吞噬作用16
2．4分泌囊泡的胞吐作用和去颗粒作用17
2．5中性粒细胞胞外陷阱19
2．6中性粒细胞功能缺陷19
2．7结论21
3幽门螺杆菌感染――炎症到癌症的路径23
3．1引言23
3．2幽门螺杆菌诱导胃癌发生的途径23 模型33
4A群链球菌和金黄色葡萄球菌引起的皮肤及软组织感染中宿主-病原体的关系35
4．1引言35
4．2阳离子抗菌肽对A群链球菌和金黄色葡萄球菌皮肤感染的抗菌机制和细菌的抗药机制36
4．3白细胞和皮肤A群链球菌和金黄色葡萄球菌感染37
4．4结论45
5败血性胞外病原菌侵染脑膜的机制：以脑膜炎球菌、无乳链球菌和大肠杆菌为例54
5．1引言54
5．2细菌通过中枢神经系统的脉管系统迁移55
5．3新生儿脑膜炎60
5．4脑膜炎64
6社区获得性肺炎的两个重要病原菌：肺炎链球菌和军团菌79
6．1背景79
6．2肺炎链球菌：一个毁灭性的病原体，同时也是一个常见的上呼吸道定植菌81
6．3嗜肺军团菌――环境存在菌，同时也造成严重散发性和流行性肺炎89
6．4结论96
7沙门菌鼠交互作用：一个研究细菌感染的通用模型104
7．1引言104
7．2致病基因的鉴定106
7．3在体内分析基因功能108
7．4深入分析在宿主组织内细胞间的相互作用113
7．5展望115
8衣原体：从分子水平洞察治疗的新发现123
8．1引言123
8．2衣原体：一种研究胞内宿主病原体间相互关系的模型124
8．3一种调查感染期间宿主细胞因子作用的整体方法129
8．4我们期望从整体化的RNA干扰（RNAi）方法得到什么信息？133
8．5展望134细菌毒力的整体研究方法145
9肠道菌群及其对内稳态的贡献147
9．1引言147
9．2胃肠道菌群的特征147
9．3肠道菌群和宿主的共生关系152
9．4结论156
10肠道屏障的解剖学和肠道内稳态建立161
10．1引言161
10．2肠道屏障的解剖学、生理学和免疫学特性161
10．3通过对菌群感知、发信号和响应建立共生关系和肠道内稳态173
10．4结论179
11通过动态影像技术在细胞、组织和器官水平探索感染过程187
11．1宿主病原体相互作用的成像简介187
11．2感染的影像学189
11．3临床意义197
11．4未来的技术发展198
12细菌感染的物种特异性问题，如何通过试验来研究？206
12．1引言206
12．2分子方面的物种特异性207
12．3用离体的人体组织使细菌侵染模型化207
12．4体内建模和相关的动物模型的探索208
12．5在体内建模关注的焦点是病原体，而不是宿主209
12．6体内建模：使用异体移植制造“人化”动物模型210
12．7人传染病免种属特异性和“人化”动物模型的遗传操作211
12．8李斯特菌作为肠道和母胎感染模型212
12．9化脓性链球菌感染：从定植宿主上皮屏障到全身性感染218
12．10脑膜炎奈瑟菌和脑脊髓膜炎221
12．11结语223
缩略语对照表230
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