第一部分 进化生物学理论
第1章 进化生物学思想
1.1 亚里士多德——博物学的萌芽
1.2 林奈——分类学
1.3 布丰——博物学、动物地理学
1.4 拉马克——进化论
1.5 居维叶——古生物学
1.6 冯贝尔与海克尔——发育生物学
1.7 达尔文——进化论
1.8 华莱士与魏格纳——生物地理学
1.9 杜布赞斯基——种群遗传学
1.10 洛伦茨、廷伯根与弗里奇——动物行为学
1.11 迈尔——系统学、进化生物学
1.12 亨尼希——系统发育系统学、分支分析学
1.13 木村资生——中性论与分子进化
1.14 21世纪进化生物学的若干发展方向
要点与问题
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参考文献
第2章 不同视角中的生命与生命的细胞前阶段
2.1 物理学视角中的生命
2.2 天文学视角中的进化
2.3 化学视角中的生命
2.3.1 水
2.3.2 碳与有机化合物
2.3.3 磷与ATP
2.3.4 金属元素
2.4 热力学视角中的进化
2.5 地球生命起源中的生物化学阶段
2.6 密码子起源
2.6.1 二联体模型
2.6.2 与核酶复制协同进化的模型
2.7 代谢起源
2.7.1 光合作用
2.7.2 无氧代谢
2.7.3 有氧代谢
2.8 研究早期进化的模拟实验
要点与问题
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参考文献
第3章 单细胞、病毒与隐生宙生态
3.1 原核生命:从单界到两界
3.2 真核细胞内共生起源
3.3 病毒系统
3.3.1 病毒分类与系统学
3.3.2 亚病毒因子
3.3.3 DNA病毒、RNA病毒、逆转录病毒
3.4 病毒与转座
3.5 多细胞化
3.6 隐生阶段生态系统的演化
要点与问题
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参考文献
第4章 生物系统学的原理与方法
4.1 分类学与分类
4.2 系统发育学派(或称分支分类学派)、进化分类学派与数值分类学派
4.3 分支分析简介
4.3.1 分支分析的一般过程
4.3.2 类群的相关基本概念
4.3.3 性状
4.3.4 分支树
4.4 主干种
4.5 超级树——树的叠加
4.6 根据系统发育关系建立自然分类的方法
4.6.1 Wiley等(1991)提出的3个规则
4.6.2 Hennig的同等级别法
4.6.3 9个约定
4.7 谱系命名规则
4.8 生命树(完全树)
4.9 基于形态信息与基于分子信息的分支分析研究
要点与问题
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参考文献
第5章 性状、选择与适应
5.1 性状及其同源
5.2 自然选择学说
5.2.1 逻辑结构
5.2.2 对达尔文进化论的一些误解
5.3 选择的类型
5.4 多基因性状
5.5 适应
5.6 形态、功能与适应
5.6.1 温度与湿度的影响
5.6.2 体型构造的意义
5.6.3 无用器官在进化上的弱化、消失
5.6.4 耐受性的进化
5.7 生态学关系与进化
5.7.1 捕食-被捕食关系与适应
5.7.2 寄生(取食)与共生、寄生(取食)与协同进化
5.8 平行与趋同
5.9 性选择
5.10 表观遗传
要点与问题
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参考文献
第6章 生活史、行为与遗传系统
6.1 生活史进化
6.1.1 生活史现象
6.1.2 生活史中的特点与适合度
6.1.3 生活史进化中的约束因素
6.1.4 生活史进化理论
6.1.5 性选择与雄性生活史
6.1.6 扩散与进化
6.2 行为进化
6.2.1 行为可以被看作一种表型
6.2.2 行为的适合度
6.2.3 最适取食理论
6.2.4 进化稳定策略
6.2.5 性选择中的行为
6.2.6 协作与社会性的进化
6.2.7 行为在进化中的作用
6.3 遗传系统进化
6.3.1 突变类型
6.3.2 有性生殖与重组
6.3.3 核型
6.3.4 性别进化
6.3.5 性比、性分配与性别决定
6.3.6 同系生殖与远系生殖
要点与问题
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参考文献
第7章 种群遗传动态
7.1 种群结构与动态
7.1.1 种群的大小与年龄结构
7.1.2 种群中个体的存活率与生命表
7.1.3 种群增长与种群密度
7.1.4 种群间的个体迁移
7.2 种群遗传的基本模型
7.2.1 哈迪-温伯格平衡
7.2.2 自然选择
7.2.3 随机遗传漂变
7.3 有效种群大小
7.4 等位基因替换概率、时间、速率
7.5 遗传多态性
7.6 种群间的地理变异
7.7 种群生物学中的分子系统学方法
7.7.1 取样概述
7.7.2 随机扩增多态DNA
7.7.3 限制性酶切片段长度多态性
7.7.4 扩增片段长度多态性
7.7.5 卫星标记
7.7.6 微阵列
要点与问题
……
第8章 进化发育生物学
第9章 分子系统发育
第10章 物种问题
第11章 显生宙的进化格局
第二部分 自然历史
第12章 绿色植物界的进化
第13章 真菌进化
第14章 无脊椎动物与昆虫进化
第15章 后口动物与鱼类进化
第16章 肉鳍动物与两栖类进化
第17章 晰形动物与鸟类进化
第18章 哺乳类进化
第19章 灵长类与人类进化
名词解释
中文索引
英文索引