序
原版前言
缩略语
a 生物信息学概述
a1生物信息学的范围
a2生物信息学与互联网
a3有用的生物信息学www网站
b 数据采集
b1dna、rna和蛋白质测序
b2蛋白质结构的确定
b3基因和蛋白质表达数据
b4蛋白质互作数据
c 数据库——内容、结构和注释
c1文件格式
c2已注释的序列数据库
c3基因组和特定物种的数据库
c4其他数据库
d 生物数据检索
d1通过entrez和 dbget/linkdb的数据检索
d2使用srs（序列检索系统）的数据检索
e 通过序列相似性标准搜索序列数据库
e1序列相似性搜索
e2氨基酸替代矩阵
e3数据库搜索：fasta和 blast
e4序列过滤程序
e5数据库的迭代搜索和psi-blast
f 多序列联配：基因和蛋白质家族
f1多序列联配和家族关系
f2蛋白质家族和模式数据库
f3蛋白质结构域家族
g 系统发育学
g1系统发育学、遗传分类学和存在论
g2构建系统发育树
g3大分子序列进化
h 序列注释
h1基因组注释原理
h2注释工具和资源
i 结构信息学
i1蛋白质结构的概念模型
i2蛋白质三维结构与蛋白质功能的关系
i3蛋白质结构和功能的进化
i4获取、观察和分析结构数据
i5结构联配
i6 已知三维结构的蛋白质分类：cath与scop
i7蛋白质结构预测简介
i8通过比较建模预测结构
i9二级结构预测
i10高级蛋白质结构预测与预测策略
j 微阵列数据分析
j1微阵列数据：分析方法
j2微阵列数据：工具和资源
j3序列采样和sage
k 蛋白质组数据分析
k1双向凝胶电泳数据分析
k2蛋白质质谱数据分析
l 高阶模型
l1分子途径的建模与重建
l2蛋白质互作生物信息学
l3高阶模型
m 生物学中的化学信息学
m1分子表示的规范
m2化学信息学资源
n 制药业中的生物信息学
n1生物信息学和药物发现
n2药物信息学资源
o 生物信息学计算的基本原理
o1运行计算机软件
o2计算机操作系统
o3软件下载和安装
o4数据库管理
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