前言
1 绪论
1.1 生物信息学的历史
1.2 生物信息学的应用
1.3 生物信息学与其他学科的关系
2 生物数据库介绍
2.1 序列数据库
2.2 基因组数据库
2.3 占构数据库
2.4 功能数据库
2.5 其他数据库资源
3 序列比对
3.1 概述
3.2 序列比对的得分系统
3.3 两条序列比对方法
3.4 多条序列比对方法
4 生物信息学常用概率统计学方法简介
4.1 概述
4.2 序列对位显著性检验
4.3 贝叶斯统计在序列对位中的应用
5 数据库搜索
5.1 数据库检索
5.2 数据库搜索相似序列
5.3 序列提交
6 分子系统发育分析
6.1 系统发育与系统发育树
6.2 距离法
6.3 最大简约法
6.4 极大似然法
7 基因组学与基因预测
7.1 引言
7.2 基因组测序技术及序列组装
7.3 功能基因组学
7.4 比较基因组学
8 蛋白质结构与功能预测
8.1 蛋白质结构简介
8.2 蛋白质三维结构分类及蛋白质家族
8.3 三维结构比对
8.4 蛋白质基本性质预测
8.5 蛋白质二级结构预测
8.6 蛋白质高级结构预测
8.7 蛋白质互作分析
8.8 药物发现与设计
9 转录组与蛋白质组分析
9.1 转录组与基因芯片简介
9.2 基因芯片数据采集与分析
9.3 蛋白质组简介
9.4 双向凝胶电泳数据分析
9.5 蛋白质质谱数据分析
10 Perl语言在生物信息学中的应用
10.1 Perl简介
10.2 数据结构和程序控制
10.3 编写生物信息学应用程序
10.4 BioPerl应用
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